Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc13P50207 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc13P50207 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms