Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psen1P49769 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms