Protein–RNA interactions for Protein: P49722

Psma2, Proteasome subunit alpha type-2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma2P49722 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma2P49722 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psma2P49722 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms