Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PtpreP49446 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PtpreP49446 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms