Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
VdrP48281 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VdrP48281 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
VdrP48281 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
VdrP48281 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VdrP48281 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms