Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfpt1P47856 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms