Protein–RNA interactions for Protein: P47774

Ccr7, C-C chemokine receptor type 7, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr7P47774 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr7P47774 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr7P47774 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms