Protein–RNA interactions for Protein: P47746

Cnr1, Cannabinoid receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnr1P47746 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cnr1P47746 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cnr1P47746 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnr1P47746 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnr1P47746 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnr1P47746 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnr1P47746 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms