Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3aP47708 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3aP47708 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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