Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp2P46686 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp2P46686 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp2P46686 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tulp2P46686 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tulp2P46686 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms