Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf1P46099 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf1P46099 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms