Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf4P43488 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfsf4P43488 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms