Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgavP43406 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgavP43406 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms