Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NodalP43021 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NodalP43021 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NodalP43021 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NodalP43021 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NodalP43021 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms