Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkx2-2P42586 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkx2-2P42586 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms