Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkx1-2P42580 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkx1-2P42580 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms