Protein–RNA interactions for Protein: P42128

Foxk1, Forkhead box protein K1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxk1P42128 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxk1P42128 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxk1P42128 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms