Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mmp9P41245 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mmp9P41245 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Mmp9P41245 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Mmp9P41245 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mmp9P41245 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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