Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syt4P40749 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms