Protein–RNA interactions for Protein: P40645

Sox6, Transcription factor SOX-6, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox6P40645 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox6P40645 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sox6P40645 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sox6P40645 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms