Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timp3P39876 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Timp3P39876 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Timp3P39876 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timp3P39876 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timp3P39876 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms