Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fen1P39749 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fen1P39749 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms