Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col18a1P39061 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col18a1P39061 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms