Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lig1P37913 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lig1P37913 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lig1P37913 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lig1P37913 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms