Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprkP35822 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PtprkP35822 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
PtprkP35822 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PtprkP35822 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms