Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PpardP35396 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PpardP35396 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PpardP35396 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PpardP35396 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PpardP35396 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PpardP35396 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms