Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab17P35292 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab17P35292 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms