Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pola1P33609 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola1P33609 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pola1P33609 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms