Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp13P33435 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms