Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nedd1P33215 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nedd1P33215 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms