Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxc5P32043 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hoxc5P32043 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms