Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ctnnd1P30999 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctnnd1P30999 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms