Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdk4P30285 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdk4P30285 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms