Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VtnP29788 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VtnP29788 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VtnP29788 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VtnP29788 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
VtnP29788 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
VtnP29788 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
VtnP29788 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
VtnP29788 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
VtnP29788 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms