Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nedd8P29595 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms