Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pabpc1P29341 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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