Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CtgfP29268 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CtgfP29268 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms