Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PtprmP28828 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprmP28828 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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