Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RxrgP28705 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxrgP28705 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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