Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxraP28700 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RxraP28700 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RxraP28700 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RxraP28700 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RxraP28700 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RxraP28700 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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