Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BgnP28653 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BgnP28653 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BgnP28653 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms