Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apex1P28352 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms