Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gja4P28235 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja4P28235 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gja4P28235 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms