Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb1P28230 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gjb1P28230 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms