Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PdgfraP26618 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms