Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ChgaP26339 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChgaP26339 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ChgaP26339 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ChgaP26339 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.6 ms