Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk11bP24788 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk11bP24788 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk11bP24788 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms