Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Htr3aP23979 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms