Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm7631-201ENSMUST00000196935 1100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm10640-202ENSMUST00000190947 1134 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AC155259.1-201ENSMUST00000214794 477 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
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Hoxd11P23813 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Hoxd11P23813 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Cks2-201ENSMUST00000075853 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd11P23813 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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