Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PparaP23204 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PparaP23204 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PparaP23204 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PparaP23204 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms